Simülasyonlar BİY.10.1.7

Tema 1 · Enerji

Hücresel Solunum: Glikozdan ATP'ye

Amaç: Glikozun sitoplazma ve mitokondride adım adım yıkılışını model üzerinde izleyerek karbon sayısındaki değişimi, açığa çıkan ürünleri ve ATP üretimini açıklamak.

1 Oksijenli solunumu adım adım izle

Karbon atomu (C) Oksijen atomu ATP (küp) NADH (eşkenar dörtgen) FADH₂ (üçgen) Elektron

2 Ürün sayacı

ATP (düz) NADH + FADH₂ (taralı) CO₂ (noktalı)
BasamakYeriATPNADH / FADH₂CO₂

Sayılar bir glikoz molekülü içindir. ATP sayıları ders kitaplarında farklı verilebilir: glikolizde net 2, Krebs döngüsünde 2 ATP; elektron taşıma sistemi sonunda üretilen ATP için eski kaynaklarda 34, güncel kaynaklarda yaklaşık 26–28 değeri kullanılır. Bu modelde toplam “yaklaşık 38” gösterilir; ders kitabınızdaki değerle karşılaştırın.

3 Kendi modelini kur ve bilimsel modelle karşılaştır

Her kart oksijenli solunumun bir basamağıdır. Kartlara sıra, gerçekleştiği yer, karbon sayısı değişimi ve oksijen gereksinimi bilgilerini seçerek modelini öner. “Karşılaştır” düğmesi modelini bilimsel modelle karşılaştırır; yanlışları 3B modelde ilgili basamağı izleyerek düzelt.

Genel denklem

C₆H₁₂O₆ + 6 O₂ → 6 CO₂ + 6 H₂O + enerji (ATP)

Denklemdeki 6 CO₂'nin 2'si pirüvat oksidasyonunda, 4'ü Krebs döngüsünde açığa çıkar. Oksijen yalnızca son basamakta, elektron taşıma sisteminin sonunda kullanılır ve suya dönüşür.

4 Günlük yaşamla bağlantı

Koşu ve yüzme

Kas hücreleri hareket için çok ATP harcar. Egzersizde solunum ve kalp atışı hızlanır; böylece mitokondrilere daha çok oksijen, glikoz ulaşır ve oluşan CO₂ uzaklaştırılır.

Nefesteki karbondioksit

Soluduğumuz havadaki CO₂, hücrelerde pirüvat oksidasyonu ve Krebs döngüsünde glikozun karbon atomlarından oluşur.

Oksijensiz kalan kas

Çok yoğun egzersizde kaslara yeterli oksijen ulaşmazsa yalnızca glikoliz çalışabilir. Bu durumda az ATP üretilir; kas hücreleri fermantasyona yönelir.

5 Ne gözlemledin?

Altı karbonlu glikoz sitoplazmada iki tane üç karbonlu pirüvata ayrılır (glikoliz); bu basamak oksijen gerektirmez ve net 2 ATP verir. Pirüvat mitokondriye girer, bir karbonunu CO₂ olarak kaybeder ve iki karbonlu hâle gelir. Krebs döngüsünde iki karbonlu molekül dört karbonlu bir molekülle birleşip altı karbonlu molekülü oluşturur; döngü boyunca iki karbon daha CO₂ olarak çıkar. Böylece glikozun altı karbonunun hepsi CO₂'ye dönüşür.

Glikoliz, pirüvat oksidasyonu ve Krebs döngüsünde oluşan NADH ve FADH₂, elektronlarını mitokondri iç zarındaki elektron taşıma sistemine verir. Elektronları en sonda oksijen alır ve su oluşur; bu süreç sonunda ATP'nin büyük kısmı üretilir. Oksijen yoksa elektron taşıma sistemi ve ona bağlı basamaklar durur.

6 Sorular

  1. Bir glikoz molekülündeki 6 karbon atomu oksijenli solunumun hangi basamaklarında ve hangi molekül hâlinde hücreden ayrılır? Karbon sayısını basamak basamak yaz.
  2. Oksijen yalnızca son basamakta kullanıldığı hâlde, ortamda oksijen yokken Krebs döngüsü neden durur?
  3. Bir öğrenci modelinde Krebs döngüsünü sitoplazmaya, glikolizi mitokondriye yerleştirmiştir. Bilimsel modelle karşılaştırarak bu modeli nasıl yenilemesi gerektiğini açıkla.
Cevap anahtarı (öğretmen için)
  1. Glikolizde 6C → 2 × 3C (karbon kaybı yok). Pirüvat oksidasyonunda her 3C'den 1 karbon CO₂ olarak çıkar (toplam 2 CO₂) ve 2 × 2C kalır. Krebs döngüsünde her 2C, 4C ile birleşip 6C olur; 6C → 5C → 4C dönüşümünde her turda 2 CO₂ çıkar (iki turda 4 CO₂). Toplam 6 karbon, 6 CO₂ olarak hücreden ayrılır.
  2. Krebs döngüsü ve pirüvat oksidasyonu NADH ve FADH₂ üretir. Bu taşıyıcılar elektronlarını ancak elektron taşıma sistemi çalışırsa bırakabilir; ETS ise elektronları alacak oksijen olmadan çalışmaz. Elektronunu bırakamayan taşıyıcılar yeniden kullanılamaz, bu yüzden Krebs döngüsü de durur.
  3. Glikoliz sitoplazmada, pirüvat oksidasyonu ve Krebs döngüsü mitokondri matrisinde, elektron taşıma sistemi mitokondri iç zarında (kristalarda) gerçekleşir. Öğrenci glikolizi sitoplazmaya, Krebs döngüsünü matrise taşıyarak ve karbon sayısındaki değişimi bu yerlere göre yeniden sıralayarak modelini yenilemelidir.